Compare commits

..

No commits in common. "master" and "master" have entirely different histories.

6 changed files with 5 additions and 119 deletions

View File

@ -1,35 +0,0 @@
---
title: Bogdan Paul Chiș
published: true
taxonomy:
category: [erasmus]
tag: [nlp, ie, rag, medical]
author: Daniel Hladek
---
ERASMUS Intern Spring 2026, 20 March - 21 May (62 days)
Topic:
(multilingual) Triplet extraction from medical data
Goal:
- Construct a knowledge graph from medical package inserts in multiple languages
- Utilize the graph in an intelligent agent that recommends medication.
Tasks:
- Learn intelligent agents and generative models - OpenAI API, Agent frameworks, RAG systems.
- Learn about knowledge graphs and GraphRAG. Read several research papers.
- Find several existing drug knowledge databases. Identify possible entities and relations.
- Prepare a Python based workflow, use git code repository
- Try Light RAG - Simple RAG.
- Scrape package inserts and parse the data.
- Index the data and write a script that extracts a knowledge graph from data.
- Visualize the graph
- Prepare an agent that utilizes the unstructured data and graph-data.
- Evaluate the agent using DeepEval or RAGAS.
- Write a report
- Put all code to GIT

View File

@ -16,33 +16,15 @@ Návrh na tému:
Prepis reči pre tvorbu štruktúrovaného zdravotného záznamu Prepis reči pre tvorbu štruktúrovaného zdravotného záznamu
Ciele:
- Vytvorte systém pre prepis reči a naplnenie formulára pomocou lokálnych jazykových modelov
- Zlepšite jazykový model pre extraktiu štruktúrovaných informácií z medicínskej alebo súdnej domény.
Úlohy: Úlohy:
- Oboznámte sa so systémom OpenWebUI - prečítajte si dokumentáciu, príp. spravte si svoju inštanciu. - Vytvorte systém pre prepis reči a naplnenie formulára pomocou lokálnych jazykových modelov
- Vytvorte jedno alebo viacero rozšírení, ktoré umožnia napňlňať formuláre pomocou rečového vstupu. - Dotrénujte jazykový model do slovenskej medicínskej domény
- Agent by mal vedieť transformovať rečový vstup do štruktúrovanej podoby.
Teoretické úlohy:
- Oboznámte sa s postupmi pre dotrénovanie jazykového modelu - LORA, PEFT.
- Oboznámte sa s metódami Information Extraction. Vyhľadajte si články na túto tému a napíšte, aké metódy sa používajú. Vstupom je text v prir. jazyku, výstupom je niečo ako JSON.
Zásobník úloh:
- Vyskúšajte ako funguje rozpoznávanie reči cez OPeWEBUI. Navrhnute zlepšenia.
- Ako vieme zistiť, ktoré informácie nám chýbajú?
## Bakalárska práca 2025 ## Bakalárska práca 2025
Návrh na tému: Návrh na tému:
Korekcia textu pomocou neurónových sietí Korekcia textu pomocou neurónových sietí

View File

@ -18,22 +18,6 @@ Expertný agentový systém na podporu rozhodovania v lekárni
Cieľ: Cieľ:
- Vylepšiť agenta pre prácu so znalostným grafom - interakcie a kontraindikácie. - Vylepšiť agenta pre prácu so znalostným grafom - interakcie a kontraindikácie.
- Zostaviť znalostný graf z databázy príbalových letákov adc a s jeho pomocou zlepšiť generovanie odpovede.
Úlohy:
- Oboznámte sa s pojmami na stránke https://graphrag.com/concepts/intro-to-graphrag/ . Napíšte is poznámky.
- Vyskúšajte si softvér https://github.com/hkuds/lightrag .
- Prečítajte si článok LightRAG: Simple and Fast Retrieval-Augmented Generation
- Oboznámte sa so systémom https://docs.ragas.io/en/stable/
Zásobník úloh:
- Využite školské LLM prístupné cez API.
- Pripravte skripty pre získanie (scarpovanie) databázy ADC.
- Zlepšite proces parsovania do formátu JSON. Môžete použiť systém Docling.
# Bakalárska práca 2025 # Bakalárska práca 2025

View File

@ -30,30 +30,9 @@ Zadanie:
Ciele: Ciele:
Vytvorte databázu pre vyhľadávanie v právnych predpisoch s využitím grafovej informácie. Vytvorte databázu pre vyhľadávanie v právnych predpisoch s využitím grafovej informácie.
Stretnutie 6.3.
- Parser vie rozparsovať zákony na paragrafy a odseky, vie verzie zákonov.
- Máme jednoduchého agenta, ktorý vie pracovať s grafovou databázou.
Úlohy:
- Pripravte vzorovú datababázy zákonov - nemusia byť všetky a vložte ju do grafovej databázy..
- Pripravte viacero testovacích scenárov pre vyhľadávanie v zákonoch. Scenár by mal byť vo forme otázky.
- Agent by mal podľa otázky vyhľadať relevatné a súvisiace paragrafy v databáze a vygenerovať odpoveď podľa paragrafov.
- Zobrazte aj zoznam zdrojov - relevantnej časti znalostného grafu.
- Kódy dajte na GIT. Mal by tam byť parser. Aj agent. Aj stručná dokumentácia.
- Pracujte na teoretickej časti práce. Napíšte o metódach GraphRAG. Používajte články z Google Scholar. Opíšte metódu zostavenia znalostného grafu, grafovú databázu aj architektúru agenta. Opíšte výsledky experimentov v testovacích scenároch.
Zásobník úloh:
- Pripravte pekné webové rozhranie.
- Pripravte deployment Vašej aplikácie - dockerfile a docker compose.
Stretnutie 4.2. Stretnutie 4.2.

View File

@ -37,17 +37,6 @@ https://github.com/RostikRd/bp2026
- Pozrite si opatrenia na https://podporneopatrenia.minedu.sk/katalog-podpornych-opatreni/ a vyberte relevantné dokumenty - Pozrite si opatrenia na https://podporneopatrenia.minedu.sk/katalog-podpornych-opatreni/ a vyberte relevantné dokumenty
- Vytvorte inteligentného agenta, ktorý by na základe dokumentov navrhol najlepšie výchovné opatrenia. - Vytvorte inteligentného agenta, ktorý by na základe dokumentov navrhol najlepšie výchovné opatrenia.
Stretnutie 6.3.
Stav:
- Prezentovaná teoretická časť
Úlohy:
- Pokračujte v písaní.
- Dajte zdrojáky na GIT.
Stretnutie 6.2.2026 Stretnutie 6.2.2026
Stav: Stav:

View File

@ -24,20 +24,6 @@ Zadanie:
3. Pomocou crawlera získajte dáta z internetu a vytvorte korpus dát pre viaceré domény. 3. Pomocou crawlera získajte dáta z internetu a vytvorte korpus dát pre viaceré domény.
4. Analyzujte získané dáta, priebeh ich sťahovania a navrhnite zlepšenia procesu získavania textových dát. 4. Analyzujte získané dáta, priebeh ich sťahovania a navrhnite zlepšenia procesu získavania textových dát.
Stretnutie 13.3.2025
Stav:
- Zozbieraných cca 450MB textu.
- Vylepšený text BP
Úlohy:
- Pridajte funciu "dolovania" domén zo získaného textu.
- Dajte kódy na GIT
- Pokračujte v dolovaní textu, min. 5GB
- zlepšite deduplikáciu a boilereplate removal - napr. justext.
Stretnutie 4.2.2025 Stretnutie 4.2.2025
Stav: Stav:
@ -53,6 +39,7 @@ Stav:
Stretnutie 18.12.2025 Stretnutie 18.12.2025
Stav: Stav: